Miles Morales, un adolescente di colore patito di materie scientifiche ma dotato di scarsa autostima, spronato dai suoi genitori partecipa a una sorta di lotteria per entrare in una scuola prestigiosa. Al di là delle più rosee previsioni Miles viene preso e il ragazzo informa subito suo zio Aaron, il fratello del padre che adora ma che è malvisto dai genitori per la sua attività criminale. Mentre i due discutono sulle opportunità che questa scuola potrebbe fornirgli, il ragno modificato emerge dallo borsa e lo punge sulla mano. Miles perde conoscenza e al suo risveglio trova suo padre e lo zio litigare riguardo a quello che è appena accaduto. Spaventato dalla reazione del padre, Miles si allontana da casa ma mentre si nasconde per strada scopre di essere invisibile e di potersi mimetizzare con l’ambiente circostante.