Il gruppo di Takasugi, Kamui & Co., che trama di assassinare lo Shogun, attacca a sorpresa il villaggio dei ninja di Iga. Inizia così un’aspra battaglia contro i membri dell’Agenzia Tuttofare, la Shinsengumi, la popolazione locale e le spie dello Shogunato, che oppongono resistenza per difendere sua altezza. Dunque Gintoki e Takasugi, che un tempo combatterono insieme per una grande causa, incroceranno la spada?!