Per riportare in vita sua sorella Yuko, caduta vittima di un drago poco dopo il loro arrivo nel mondo di Final Fantasy, Shogo e compagni sono alla ricerca delle magie leggendarie. Il loro obiettivo è Reiz, l'incantesimo di resurrezione. Approdati a Mysidia, il regno della magia, vengono coinvolti in un conflitto tra due fazioni: le tre sorelle Magus, rivoluzionarie pronte a usare tecniche proibite per rovesciare lo status quo, e la famiglia reale. Durante l'incoronazione della principessa Sara, probabile teatro dello scontro finale, in Shogo si risveglia un nuovo potere.